בוגרי מערכות מידע עוסקים כיום במגוון גדול של תפקידים ונושאים, בהתאם ליכולותיהם ולאופיים. יהיו בוגרים שיעדיפו לעסוק בתכנות, אחרים שיעדיפו לעסוק בניתוח צרכים ובתכנון, ובוגרים אחרים שיעדיפו לעסוק בהטמעת מערכות בארגון ואולי גם בהתאמתן לצרכי הארגון. בדרך כלל הבוגרים משתלבים במסגרת אגף מערכות המידע בארגון בתפקידי תכנון, ניתוח, אפיון, פיתוח, הטמעה וניהול של מערכות המידע. תפקידים נוספים כוללים עיצוב, תכנון (ופיתוח) אתרים, שירותי אינטרנט, ניתוח ועיצוב מערכות מידע, אחזור מידע, כריית וניתוח מידע ועוד.