הפרקטיקום מתקיים בבתי הספר ונמשך שנתיים. קורס הפרקטיקום הנלמד במכללה מהווה חוליה מקשרת בין התיאוריה הנלמדת בחוג לבין ההכשרה המעשית, כפי שהיא מתבצעת בשדה. הקורס מקנה מושגים, המרחיבים את הידע לגבי תהליכים אישיים וקבוצתיים ולגבי תפקידיו המגוונים של היועץ החינוכי. התנסות מעשית במשך שנתיים בבתי הספר והשתתפות בקורס מכשירים את הסטודנטים להיות יועצים חינוכיים מקצועיים, בעלי ידע ומודעות עצמית גבוהה, אמפתיה ומחויבות למקצוע. במהלך כל תקופת הפרקטיקום מקבלים הסטודנטים הדרכה צמודה הן ממרצי הקורס והן מיועצים מאמנים בבתי הספר. מעבר לשיעורים, הסטודנטים מקבלים גם הדרכה אישית וקבוצתית לגבי דילמות העולות מהשדה. ההדרכה ניתנת על ידי מנחות פרקטיקום מנוסות הזמינות לסטודנטים במהלך השבוע.
הלימודים מתקיימים במהלך יומיים בשבוע, החל משעות הצהריים.
הפרקטיקום בבתי הספר מתקיים בשעות הבוקר ובער"ן השעות נקבעות בתאום עם הסטודנטים.
- פרויקט גמר: הסטודנטים בתכנית מגישים עבודות גמר במסגרתן נעשית עבודת מחקר, בשיטות מחקר איכותניות/כמותניות.